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叛匪各部会合一处，败势稍止，乌泰急忙叩拜葛根活佛，祈求显灵退敌。可这位活佛元帅听闻战事大败，又见乌泰所部十剩二三的惨状，吓得惊慌失措，颤栗不已。勉强打起精神头儿求佛“显灵退敌”，却是一点不灵。不仅没见到腾云驾雾、刀枪不入的喇嘛神兵，更看不到天上掉石头，连片雪花也没落。
此时，政府军的大部队终于赶到了洮南县。吴俊升的人马气势又盛，再次向叛军发起了进攻。此时叛匪军心已乱，士气衰弱，只是胡乱抵挡了一阵，乱放几枪，拔腿又跑。
乌泰的叛军败进葛根庙，想凭借镇中心葛根大庙高墙瓦寺之险，抵挡官军几日，以为喘息之机。于是三路兵马拼凑了一千余众，负隅顽抗。
葛根庙是内蒙中部的大镇，庙宇鳞次栉比，人烟密集，市井繁华。既是军事要塞，也是农牧商业中心。当时居民就达十万多人。再加上札、镇两旗迁入的难民四万余人，搭起的“天幕”和蒙古包连接起来绵延数里，拥挤不堪。
葛根庙又是乌泰“独立”动乱的总指挥部和大本营。各寺庙的喇嘛们天天烧香唪经，迎神送鬼，祈祷上苍，保佑乌泰的“独立”之举成功。在这喧嚣声中，迎来了屡战屡败的溃逃者，各寺庙顿时陷入一片混乱。第六世葛根“元帅”下子道“法旨”，说有外蒙古活佛的援军，能得到武器弹药等等。他要求大家镇静，拼死抵抗。其实，大家都看到，这个年仅十七岁的活佛“元帅”惊慌失措的样子比谁都厉害。
乌泰败进葛根庙的第二天，吴俊升率领轻骑三营便追击而至。在查看了葛根庙的地势地形后，觉得易守难攻。倘若硬攻，必然有很大伤亡，于是只虚围镇子，等待步兵和炮兵的到来。
两天之后。步、炮六营士兵赶到，总攻的时机到了。
炮兵在葛根庙南南盂西哈达山顶上架起大炮，瞄准了葛根大庙叛军司令部，又命万福麟率骑兵于南门待命，总攻打响后。即率马队冲入，然后由石得山率步兵跟进。
炮兵营营长李志信，将炮位再三校正后，开炮轰击。第一炮就落在庙院中心，惊得叛军乱成一团，纷纷躲进庙内。这些叛军没有作战经验，炮击时，越往屋里躲越危险，应该在空阔地上趴伏，伺机滚进弹坑才保安全。
炮弹接二连三地飞来。几炮便把大殿西角炸塌，殿脊上铜顶被震落在地。这被活佛、喇嘛们视为“不祥之兆”。此时，“法旨”、“佛咒”完全失灵了，动乱者从“元帅”、“统领”到众蒙古兵丁都知道大势已去。乌泰、硕代等叛军首领胆颤心寒，凿开大庙后墙，狼狈逃窜，向札萨克图王府逃命而去。
等万福麟得到命令，率马队向镇内冲击时，防守南门的叛军早已望风而逃，一路没有遇到抵抗便杀进葛根庙。见乌泰已经潜逃。又马不停蹄，直追而去，一直追击到归流河南岸方停止前进。
乌泰逃到王府，才略有喘息之机。检视人马。所剩不过三百骑，轻重伤者又将近一小半。而外蒙古的援军仍然未到，又获悉从黑龙江省又有一支官军开来，将与吴俊升部合攻王府。最要命的是嘎钦已被官军占领，逃往外蒙古的退路已被切断，真是穷途末路。
……………
中国革命发生后。俄国就有意与日本合作，共同出兵占领中国东三省。由于英、美等国坚决主张列强对华一致行动，俄国考虑欧洲局势更为紧要，不愿在中国问题上与英、美对立，便又向日本政府提议由日本带头共同瓜分东三省。
而日本重视与英国的同盟关系，也不愿开罪英国，予以拒绝。沙皇政府迫不及待，一手导演外蒙“独立”之后，又唆使哲布尊丹巴以“蒙古君主”的名义联络内蒙地区的王公，煽动他们率众叛乱，脱离中国。
然而，东北军区对蒙叛乱反应迅速，用兵果断。乌泰穷途末路，在“十八罗汉”等亲兵护卫下，放弃王府，连夜逃往索伦山。随后，黑龙江省驻军攻破拉什敏珠尔的镇国公府，拉什敏珠尔下令“自行焚毁”公府，在混乱中带少部分亲随败逃海拉尔。
东北军区部队历时一个多月，经过大小战斗三十余次，彻底平定了乌泰、拉什敏珠尔的“独立”动乱。击毙叛匪七百五十七人，击伤千余人，缴获各种枪支五百余杆，有力地打击了分裂势力，维护了祖国统一。
同时，东北军区剿匪部队借此机会，取得了增兵内蒙的名义和事实，开始从东面向外蒙逼近。但困难还是很大的，姚雨平电示中央：“购备粮台筹款非易，不得不暂从缓办，仍望激励将士严防勿懈。且蒙地环境恶劣，蒙边一带地极寥阔，我军向未经过，所有该山川形势以及便于攻守各要隘均属茫然，难期致胜，请由中央函致测量局，速将前测该处地图检发若干份从速寄来，以便考察攻守之地点。另外蒙叛军大部为骑兵，行动快速。我军出探搜索及传达命令，以及抄袭御敌迅速，非有得力马队，万难取胜。”
根据蒙古地区的自然条件，自古以来用兵作战利于骑兵，不利于步兵。外蒙叛军行动快速，这就多少弥补了其数量不足和组织不严的弱点。政府军的装备虽优于叛军，但多数是步兵，行动缓慢，以致外蒙叛军向内蒙进犯，政府军经常受到袭击。
当一地吃紧时，增援部队往往缓不济急，以致遭到不少损失。只有就地招募和改编部队，组建骑兵营、团，并从后方增调骑兵部队，从而大大改善部队的机动能力，才能进军外蒙，与叛军作战。
为了进一步了解与蒙匪作战的经验和不足，陆军部特发电令，召吴俊升、万福麟等军官进京汇报。并将进行表彰嘉奖。
同时，陆军部又作出了一连串的军事部署，以防备外蒙叛匪窜犯。热河、察哈尔、山西、绥远等地的驻军开始进行集结并开赴各军事要点。总计共有官兵三万九千九百余人，大炮八十六门。机关枪一百四十八挺。
另外，大批援军也得到命令，开始向滂江（今内蒙苏尼特右旗东二十五公里）、拜申图（今内蒙乌拉特中后联合旗东北三十公里）、大佘太诸要隘开进。